Cikal bakal berdirinya Universitas Sragen (UNISSRA) di awali dari Akademi Keperawatan Sragen dengan badan penyelenggara Yayasan Pendidikan Unggulan Sragen (YAPENAS) dengan ijin operasional Nomor SK 225/D/O/2002. Selang tiga (3) tahun pendirian tepatnya tahun 2005 Akademi Keperawatan Sragen berubah nama menjadi Akademi Keperawatan YAPPI Sragen dengan badan penyelengara Yayasan Pondok dan pendidikan Islam (YAPPI) yang diketuai oleh H Fahrur fatoni. Melihat animo masyarakat Sragen yang cukup baik terhadap prodi bidang kesehatan kemudian yayasan memutuskan untuk membuka Prodi kesehatan lainya yakni Prodi Kebidanan dan tepatnya pada tahun 2006 Akademi kebidanan YAPPI Sragen resmi berdiri dengan SK Ijin operasional Nomor 208/D/O/2006. 
Pada tahun 2023 dengan pergantian pengurus yayasan yang tertuang dalam perubahan anggaran dasar (YAPPI) Akta Notaris Muhammad Dahlan Muladi SH No 9 tahun 2023 Yayasan berkomitmen untuk merubah bentuk Akademi Keperawatan YAPPI Sragen dan Akademi Kebidanan YAPPI Sragen untuk menjadi sebuah Universitas. Dengan perjuangan yang keras akhirnya pada tahun 2024 tepatnya 22 Maret ijin operasional Universitas Sragen (UNISSRA) dari Kemendikbudristek resmi turun dengan Nomor SK 250/E/O/2024. Dengan turunya ijin operasional tersebut maka UNISSRA siap beroperasional pada tahun 2024 menjadi satu-satunya Universitas di Kabupaten Sragen.
Terdapat 3 (tiga) Fakultas di UNISSRA antara lain Fakultas Informatika dan Kesehatan (FIKES) dengan prodi DIII Keperawatan, Sarjana Fisioterapi, Sarjana Administrasi Rumah Sakit dan Sarjana informatika, Fakultas Hukum (FH) dengan Sarjana Hukum dan Fakultas Ilmu Keguruan dan Pendidikan dengan prodi Sarjana PGSD. Meski tergolong Universitas baru UNISSRA berkomitmen untuk selalu mengembangkan diri agar mampu bersaing dengan perguruan tinggi di sekitar khususnya di soloraya sehingga dapat memberikan kemanfaatan khususnya masyarakat sragen dan Indonesia umumnya.